KDD’21 tutorial

EHR数据：

  • 结构化:
    • 人口统计资料（demographics)：年龄、性别、经济状况、保险类型、语言、种族、居住条件、家庭结构、地理位置、工作
    • 用药（medications）：医药处方、非处方药、毒品、酒精
      • 代码：NDC, RxNorm
    • 实验室结果（laboratory results）：血液、尿液、粪便、唾液、脊髓液、腹水、混合液、骨髓、肺
      • 代码：LOINC
    • 账单（billing）：
      • 诊断（diagnoses）:ICD-9,10
      • 程序（procedures）：CPT, ICD
    • 持续的监护数据（continuous monitoring data）：心率、脉搏、呼吸率、体温、氧饱和度、血压
    • 多种类型的医学代码（multi-typed medical codes）
  • 非结构化：
    • 临床笔记与报告（clinical notes and reports）：出院小结，主治与住院，护士，专科（放射、病理、心电图、营养、呼吸），会诊医生、咨询医生、急诊科
    • 医学图像（medical images）：X-ray, CT, MRI, PET

任务（analytics tasks）：

  • 表型（phenotyping）：心律不齐、肾衰竭、失眠
  • 风险预测
  • 用药建议
  • 疾病分类
  • 医学语言翻译
  • 医学报告生成
  • 临床试验挖掘

结构化健康数据（structured health data）

  • 表型：从EHR数据中学习医学概念表示
    • Med2Vec, dipole, GRAM, KAME, HAP, Integrating multimodal EHR,
  • 疾病/风险预测
    • RETAIN, LSAN, HAM, TAM, HiTANet, MedPath, MedRetriever
  • 治疗建议
    • LEAP, GAMENet

非结构化数据

  • 自动ICD编码/疾病分类
    • HyperCore, C-MemNN, CAML, Fusion
  • 医学语言翻译
  • 医学报告生成
  • 临床试验挖掘